Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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NCAPHQ15003 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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NCAPHQ15003 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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NCAPHQ15003 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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NCAPHQ15003 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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NCAPHQ15003 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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NCAPHQ15003 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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NCAPHQ15003 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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NCAPHQ15003 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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