Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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