Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms