Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK13Q14004 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
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