Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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CAPSQ13938 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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CAPSQ13938 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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CAPSQ13938 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPSQ13938 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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CAPSQ13938 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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CAPSQ13938 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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CAPSQ13938 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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CAPSQ13938 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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CAPSQ13938 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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CAPSQ13938 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPSQ13938 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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