Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF9Q13886 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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