Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNTB1Q13884 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms