Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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NCOA4Q13772 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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NCOA4Q13772 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
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NCOA4Q13772 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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NCOA4Q13772 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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NCOA4Q13772 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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NCOA4Q13772 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NCOA4Q13772 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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