Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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