Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms