Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
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C1orf61Q13536 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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C1orf61Q13536 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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C1orf61Q13536 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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C1orf61Q13536 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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C1orf61Q13536 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1orf61Q13536 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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