Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2V1Q13404 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms