Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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