Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
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