Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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NR1H3Q13133 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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NR1H3Q13133 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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NR1H3Q13133 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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