Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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