Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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