Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF2Q12947 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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