Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC173Q0VFZ6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms