Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN5Q08AF3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms