Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms