Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms