Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ID3Q02535 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ID3Q02535 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms