Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC6A3Q01959 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms