Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms