Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms