Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms