Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms