Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIM1P81133 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIM1P81133 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms