Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM258P61165 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms