Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms