Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PGGT1BP53609 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PGGT1BP53609 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PGGT1BP53609 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PGGT1BP53609 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PGGT1BP53609 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PGGT1BP53609 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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PGGT1BP53609 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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