Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP98P52948 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP98P52948 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP98P52948 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP98P52948 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP98P52948 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP98P52948 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP98P52948 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP98P52948 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP98P52948 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP98P52948 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP98P52948 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP98P52948 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms