Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DAP3P51398 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DAP3P51398 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms