Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9AP51151 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms