Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRIP1P50238 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms