Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTPAP49638 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTPAP49638 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTPAP49638 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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