Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms