Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms