Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RANGAP1P46060 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms