Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAD52P43351 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD52P43351 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms