Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3CBP42338 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms