Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPAP38571 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPAP38571 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPAP38571 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIPAP38571 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms