Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms