Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A5P29400 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms