Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCAP28676 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCAP28676 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GCAP28676 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GCAP28676 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GCAP28676 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GCAP28676 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GCAP28676 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GCAP28676 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GCAP28676 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GCAP28676 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GCAP28676 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GCAP28676 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GCAP28676 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GCAP28676 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GCAP28676 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GCAP28676 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GCAP28676 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GCAP28676 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GCAP28676 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GCAP28676 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GCAP28676 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms