Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMB4P28070 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms