Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DMAP28067 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms