Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNCP24821 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNCP24821 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNCP24821 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNCP24821 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNCP24821 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNCP24821 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNCP24821 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNCP24821 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNCP24821 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNCP24821 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNCP24821 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNCP24821 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNCP24821 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNCP24821 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNCP24821 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNCP24821 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNCP24821 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNCP24821 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TNCP24821 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNCP24821 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNCP24821 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNCP24821 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TNCP24821 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNCP24821 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNCP24821 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNCP24821 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNCP24821 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNCP24821 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNCP24821 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNCP24821 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNCP24821 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNCP24821 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms