Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms